Il nuovo sistema operativo 02R versione 2, disponibile da ottobre 1997, permette un notevole ampliamento delle possibilità applicative del banco. Il kit per l'upgrade (contenente 2 EPROM, le istruzioni per l'installazione e il manuale d'uso versione 2).

Ecco alcune tra le più interessanti funzioni implementate:

Ingressi riassegnabili. E' possibile assegnare liberamente gli ingressi ai canali entro i limiti di una serie di matrici 8x8. Un singolo ingresso può essere associato a più canali contemporaneamente: ciò permette di ottenere facilmente "copie" di segnali in ingresso, utilizzabili per il controllo dei processori dinamici o per effetti particolari. E' possibile reindirizzare i bus agli ingressi tape, ottenendo in questo modo in contemporanea un secondo mix indipendente (una modalità di gestione molto simile all'utilizzo di una sezione matrix).

Uscite riassegnabili. Grazie alla completa implementazione dello standard YGDAI, anche le mandate aux e gli stereo out possono essere inviati alle uscite delle schede. Viceversa i bus possono essere inviati anche alle uscite analogiche AUX 1-6.

Registrazione a 24-Bit. Sono possibili registrazioni a 24-bit con unità di registrazione MDM come ALESIS ADAT-XT o TASCAM DA-88 (utilizzando 2 tracce contemporaneamente per ogni canale a 24 bit).

MS decoding. Gli ingressi configurati come coppie stereo possono essere utilizzati per la gestione di segnali microfonati con tecnica mid-side.

Gruppi controllabili in tempo reale. I rapporti di livello tra i canali appartenenti ad un fader group possono essere variati in tempo reale, senza la necessità di richiamare la videata corrispondente.

Fader touch sensing. La definizione del canale selezionato può avvenire ora in modo automatico semplicemente spostando i fader, senza la pressione del tasto [SELECT] come avveniva in passato. Esiste inoltre un'opzione supplementare che consente di utilizzare il touch sensing durante le sessioni di automix per selezionare automaticamente il canale da registrare, evitando, anche in questo caso, di premere il tasto [SELECT].

MIDI Control Change / MIDI Remote. Oltre ai Sysex, lo 02R può ricevere ora anche semplici messaggi MIDI di Control Change per il controllo di faders, on/off di canale, pan, EQ, eccetera. Il banco può anche essere utilizzato come remote controller per programmare a distanza unità collegate via MIDI. Tra gli editor implementati, segnaliamo quelli per i nuovi processori ProR3 e REV500 Yamaha e un editor specifico per Digidesign Pro Tools, in grado di controllare trasporto, livelli, pan, eccetera. E' possibile inoltre il controllo a distanza di altri banchi Yamaha collegati (02R, 03D, ProMix01). Interessante la possibilità di registrare i controlli effettuati nella modalità MIDI Remote all'interno della memoria di automix.

MIDI Machine Control. E' implementato il controllo a distanza dei registratori compatibili MMC che ora possono essere pilotati direttamente dal banco. Sono disponibili 8 locatori programmabili manualmente oppure con la tecnica del time code capture.